中国水产科学 , 2013, 20(5):939-. doi:10.3724/SP.J.1118.2013.00939
摘要:利用本实验室获得的杂色鲍(Haliotis diversicolor)转录组测序数据库, 筛选出杂色鲍紫色酸性磷酸酯酶(Purple acid phosphatase, PAP)同源片段, 进而克隆获得PAP 的cDNA 全序列, 命名为HdPAP, 并进行了HdPAP 蛋白的结构分析和功能预测, 同时利用实时定量PCR(qRT-PCR)技术分析HdPAP 基因的组织表达谱和应激条件下的HdPAP 表达变化。HdPAP 基因cDNA 全长1 215 bp, 含有1 个编码322 个氨基酸的969 bp 的开放阅读框。经Blast比对, 与无脊椎动物半索动物门囊舌虫(Saccoglossus kowalevskii)的PAP 氨基酸序列一致性最高, 达59%。通过实时定量PCR 检测, HdPAP 在检测的杂色鲍各组织中均有表达, 其中在血细胞和肝胰腺的表达量显著高于其他各组织(P<0.05)。高温应激下, 在检测的6 个时相中, HdPAP 在血细胞、肝胰腺和鳃中均出现不同程度的表达抑制。缺氧应激后, 4 h 血细胞中HdPAP 显著低于对照组, 24 h 恢复到正常水平, 96 h 显著高于对照组(P<0.05), 到192 h 又恢复到正常水平。副溶血弧菌感染实验中检测到HdPAP 在血细胞中同样出现表达抑制现象, 3 h 和6 h 均检测到感染组HdPAP 表达量显著低于对照组(P<0.05)。PAP 在高温、缺氧及弧菌感染下显著的表达抑制从转录水平揭示了其作为表达下调的酯酶可能参与胁迫下的生物代谢和免疫反应。
水产学报 , 2013, 37(6):830-. doi:10.3724/SP.J.1231.2013.38463
摘要:同种移植炎症因子AIF-1(allograft inflammatory factor 1,AIF-1)是一种由干扰素γ诱导的含有EF-hand结构域的钙离子结合蛋白,其功能主要是参与移植排斥、免疫炎症反应、自身炎性和非炎性的损伤等。首次克隆了杂色鲍AIF-1基因cDNA全序列,命名为HdAIF-1,其全长为942 bp,开放阅读框为456 bp,编码151个氨基酸。实时荧光定量PCR结果表明: HdAIF-1在杂色鲍各组织中均有表达,其中在血淋巴和鳃中表达量最高。高温应激下,HdAIF-1在鳃组织中各时相表达均显著上调,并在温度升至31 ℃时达到最高。而血淋巴和肝胰腺中HdAIF-1在高温应激前4个时相表达无显著差异,到了96 h均显著上调。缺氧应激下,HdAIF-1在血淋巴中表达变化没有显著差异,而鳃中24 h显著下调,192 h显著上调。副溶血弧菌感染实验表明HdAIF-1基因在感染后3、24 和48 h均检测到HdAIF-1的表达量显著上调。高温和缺氧应激以及弧菌感染均显示HdAIF-1基因表达量发生显著变化,说明HdAIF-1可能作为免疫因子在杂色鲍应激等状况下发挥重要作用。
水产学报 , 2016, 40(7):1018-. doi:10.11964/jfc.20150609948
摘要:抗细胞凋亡因子(DAD1)是细胞凋亡的负调控因子。在杂色鲍转录组测序的基础上,通过RACE的方法,获得了杂色鲍DAD1基因的全长cDNA,命名为HdDAD1。该序列全长553 bp,开放阅读框339 bp,编码112个氨基酸。编码蛋白具有保守的DAD功能域和3段跨膜区。实时定量PCR结果表明,HdDAD1在杂色鲍所检测组织中均有表达,消化道、鳃、血细胞、粘液腺和肾脏中表达量最高。同样,HdDAD1在发育各阶段均有表达,幼虫阶段表达量最高,原肠胚次之,其他胚胎发育阶段和稚鲍表达量最低。HdDAD1能够响应细菌感染、高温和缺氧应激。在弧菌注射12 h后,表达量显著上升。当水温由最适的25℃上升到28℃时,HdDAD1表达量升高;在31℃持续4和96 h时HdDAD1表达量显著上升。在低氧处理4和96 h时,HdDAD1的表达量也显著上升。
水产科学 , 2016, 35(3):227-. doi:10.16378/j.cnki.1003-1111.2016.03.006
摘要:激活蛋白1(AP-1)是具有亮氨酸拉链功能域的转录因子,参与了发育和免疫等多个生物学过程。为研究该基因在杂色鲍发育和免疫中的作用,本研究克隆了杂色鲍AP-1基因的全长cDNA(命名为HdAP-1),并分析了HdAP-1在各组织、各发育时期以及副溶血弧菌刺激后的表达特征。结果表明,HdAP-1 cDNA全长为1482 bp,5'非编码区域(5'UTR)为133 bp,3'UTR为401 bp,开放阅读框为948 bp。该基因编码蛋白预测分子量为34.83 ku,等电点为9.43,具有典型AP-1蛋白家族的Jun转录因子功能域和bZIP功能域。HdAP-1在所检测7个组织中均有表达,其中血淋巴表达量最高,鳃、肾、肠和黏液腺的表达量次之,肝胰腺和外套膜表达量最低。自受精卵至囊胚期HdAP-1的表达量显著低于原肠胚(P<0.05),由原肠胚到担轮幼虫该基因表达量继续上升,担轮幼虫至匍匐幼虫期均维持较高的表达水平,变态后在稚鲍中的表达量下降。在副溶血弧菌感染24 h后,HdAP-1表达量显著上升(P<0.05)。其他时段该基因的表达量与对照组相比差异不显著(P>0.05)。
南方水产科学 , 2011, 7(3):72-. doi:10.3969/j.issn.2095-0780.2011.03.013·研究简报·
摘要:动物线粒体遗传模式主要为母系遗传。近年来在一些双壳类(如贻贝科、蚌科和帘蛤科)中发现了线粒体双重单亲遗传现象。双重单亲遗传完全不同于传统的母系遗传模式,它开启了一种独特的系统来检测进化力在线粒体基因组中的作用。但双重单亲遗传是否广泛存在于双壳类尚属未知。文章研究了虾夷扇贝(Patinopecten yessoensis)的线粒体遗传模式,结果显示,同一个体中体细胞和性腺的线粒体片段的基因型不存在差异;家系检测中也显示子代的线粒体单倍型与母本一致;在虾夷扇贝线粒体中未发现双重单亲遗传现象。