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2013, 34(6): 59-67.

魁蚶4个地理群体遗传多样性微卫星分析

1. 青岛通用水产养殖有限公司, 266404

2. 青岛智达海洋科技有限公司, 266237

3. 青岛市菜篮子商品质量监督检测中心, 266071

4. 莱州明波水产有限公司, 261400

5. 烟台开发区天源水产有限公司, 264003

6. 深圳华大基因研究院, 518083

7. 河北省黄骅市水产局, 061101

8. 大连海洋大学, 110623

9. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 青岛市海水鱼类种子工程与生物技术重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所, 266071

10. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 山东省渔业资源与生态环境重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所, 青岛 266071

11. 农业部海洋渔业可持续发展重点实验室 中国水产科学研究院黄海水产研究所, 青岛 266071

12. 中国海洋大学水产学院, 青岛 266003

13. 中国海洋大学, 青岛 266003

14. 上海海洋大学水产与生命学院, 201306

通讯作者: 刘志鸿, liuzh@ysfri.ac.cn

收稿日期:2012-05-02
修回日期:2012-07-24

基金项目:   国家科技基础条件平台项目“黄渤海区水生生物种质资源标准化整理、整合与共享”、山东省科技发展计划项目(2010GHY10513)和中央级公益性科研院所基本科研业务费项目(2010-ts-07)共同资助 

关键词: 魁蚶 , 微卫星 , 地理群体 , 遗传多样性

Microsatellite analysis of genetic diversity in four geographic populations of Scapharca broughtonii

Corresponding author: LIU Zhi-hong, liuzh@ysfri.ac.cn

Received Date:2012-05-02
Accepted Date:2012-07-24

Keywords: Scapharca broughtonii , Microsatellite , Geographic populations , Genetic diversity

利用多态性好的20对微卫星引物,对中国日照、黄岛、蓬莱和韩国的4个魁蚶地理群体进行了遗传多样性分析。结果显示,20个位点在4个群体中的等位基因数为3~17,平均等位基因数为8.35,平均有效等位基因数为6.230 6;观测杂合度(Ho)为0.466 7~0.966 7;期望杂合度(He)为0.619 8~0.931 8;多态信息含量(PIC)为0.530 1~0.909 3,表现出高的遗传多样性水平。4个群体间的遗传分化指数(Fst)在0.013 2~0.031 4之间,呈现出较低的遗传分化。群体间的遗传距离在0.125 5~0.245 8之间;通过构建UPGMA聚类树,显示日照群体和黄岛群体最先聚类,再与蓬莱群体聚类,最后与韩国群体聚类,说明中国群体与韩国群体亲缘关系较远。

Genetic diversity in four geographic populations of Scapharca broughtonii from Rizhao, Huangdao, Penglai, and Korea was analyzed using twenty SSR with high polymorphism obtained in our laboratory. Results showed that the number of alleles obtained from different populations ranged in 3-17.The average number of alleles and effective alleles were 8.35 and 6.230 6, respectively. The observed heterozygosity(Ho) and the expected heterozygosity(He) ranged in 0.466 7-0.966 7 and 0.619 8-0.931 8, respectively.The polymorphism information content(PIC) ranged in 0.530 1-0.909 3, indicating a high level of genetic diversity in these populations.The genetic differentiation index (Fst) of the four geographic populations ranged in 0.013 2-0.031 4, revealing a low level of genetic differentiation among them. The genetic distances among populations ranged in 0.125 5-0.245 8. The UPGMA tree indicated that Rizhao and Huangdao populations clustered first,then clustered with Penglai population, and further clustered with the Korean population, indicating that the Korean population was the farthest relative of the Chinese populations. The information of population structure obtained in this work would be helpful for the genetic breeding and conservation of S. broughtonii.

参考文献

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[1] 陈晶, 聂青, 刘妍. 《WHO基本药物示范目录》与我国《国家基本药物目录》动态调整程序比较与借鉴.水产学报,2015(3): 289-293.doi:10.3866/PKU.WHXB201503022
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